厦门海关始设于1684年，时称“闽海关厦门口”，至今已有335年的历史。现为直属海关总署的正厅级单位，下设21个职能部门（含副厅级缉私局），14个隶属单位，10个正处级事业单位；拥有全国唯一的“海峡两岸农产品检验检疫厦门中心”，共有国家重点实验室15个、区域性中心实验室13个。现有干部职工3027人，离退休人员645人。